美国加州大学任兵
⑴ 求《Lysine 2-hydroxyisobutyrylation is a widely distributed active histone mark》这篇nature的翻译
摘要:关键词蛋白质翻译修饰赵英明位点随着人们对蛋白质功能和生物学机制的研究的逐步深入蛋白质翻译后修饰的重要性与日俱增比如磷酸化乙酰化甲基化泛素化和糖基化等翻译后修饰是真核细胞生物调节蛋白质发挥生物学功能的重要方式对发育代谢疾病等众多生理过程均起到关键的调控作用过去十年来以上的重磅抗癌药物年销售额超过亿美元的作用靶点是磷酸化调节酶
关键词:蛋白质,翻译,修饰,赵英明,位点
随着人们对蛋白质功能和生物学机制的研究的逐步深入,蛋白质翻译后修饰的重要性与日俱增。比如磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化和糖基化等翻译后修饰是真核细胞生物调节蛋白质发挥生物学功能的重要方式,对发育、代谢、疾病等众多生理过程均起到关键的调控作用。过去十年来, 50%以上的重磅抗癌药物(年销售额超过10亿美元)的作用靶点是磷酸化调节酶。组蛋白的翻译后修饰,因其会影响基因的转录,是表观遗传调控的核心部分,对于许多生物过程和疾病发生有着至关重要的影响。近日,芝加哥大学赵英明课题组在化学类顶级杂志nature子刊《nature chemical biology》上报道了一种新型的组蛋白翻译后修饰--赖氨酸二羟基异丁酰化,并指出组蛋白h4k8上的二羟基异丁酰化对精子细胞的分化起到重要的调控作用。这是继丙酰化、丁酰化、琥珀酰化、巴豆酰化、丙二酸酰化和戊二酸酰化修饰后又一重大发现。这一工作是赵英明课题组和法国格勒诺布尔第一大学的saadi khochbin教授,加州大学圣地亚哥分校的任兵教授,以及洛克菲勒大学的c. david allis教授共同完成,戴伦治博士是文章的第一作者,赵英明教授是通讯作者。
在该工作中,赵英明课题组综合运用化学和生物化学等方法发现并且系统地证明了从原核生物到高等哺乳动物的组蛋白上普遍存在着赖氨酸二羟基异丁酰化。这个新型的蛋白质翻译后修饰存在以下特点:1、修饰位点多。研究人员从组蛋白中鉴定出63个赖氨酸二羟基异丁酰化位点。这一数目远高于已知的组蛋白乙酰化位点数目。63个组蛋白修饰位点是一个相当可观的数目,在乙酰化报道后的40年多年里(1964-2006),全球众多的课题组一共才鉴定了大约100个组蛋白翻译后修饰位点。截至目前为止,赵英明课题组已经鉴定出200多个组蛋白修饰位点。 2、分布广。大多数乙酰化位点主要存在于组蛋白的n-端,而二羟基异丁酰化不仅存在于组蛋白的n-端,而且也广泛存在于组蛋白的c-端。3、丰度高。基于silac技术的定量分析表明,组蛋白赖氨酸二羟基异丁酰化位点的丰度比一些已报道的具有生物学功能的乙酰化位点高。4、动态变化。研究人员比较了细胞有丝分裂的不同时期、精子细胞减数分裂的不同阶段以及四膜虫的大核和小核中的二羟基异丁酰化的变化,结果表明二羟基异丁酰化在这些生物学过程中处于动态变化状态。研究人员进一步运用免疫荧光,免疫组织化学和chip-seq技术对精子发育过程中组蛋白h4k8上的乙酰化和二羟基异丁酰化进行了研究,发现在精母细胞中,特别是在减数分裂后期的圆精细胞中,h4k8二羟基异丁酰化比乙酰化对精子发育过程中的相关基因具有更加广泛的调控功能,这为今后其生物学功能研究奠定了基础。
蛋白赖氨酸翻译后修饰是目前生命科学领域的前沿和研究的热点之一。各种各样的赖氨酸修饰的发现不仅不是多余,反而更体现了其在生命发育过程和基因调控中的复杂性和多样性。鉴定疾病发展早期蛋白质翻译后修饰的位点,对于疾病诊断和治疗可能有着重要的指导意义。此外,随着调节这些赖氨酸修饰的酶的发现,这些修饰的生物学功能将会得到进一步揭示。(生物谷bioon.com)
⑵ 任兵的个人简历
任兵,男,汉族,1958年9月生,河北张家口人,1976年3月,参加工作,1978年10月入党,大学学历。
现任石家庄市安全生产监督管理局调研员
1976.12-1981.05炮兵第六三四团一营二连战士、排长
1981.05-1981.09198 193师第579团连副政指、政治处副连职干事
1981.09-1982.07石家庄陆军学校指导员班军队政治工作专业学员
1982.07-1983.0465军193师第579团政治处组织股副连职干事
1983.04-1984.12步兵第五七九团炮兵营107火箭炮连政指
1984.12-1985.09步兵第五七九团政治处组织股副营职干事、股长
1985.09-1986.09长沙干部文化学校学员
1986.09-1988.07陆军指挥学院部队政治工作专业学员
1988.07-1994.02步兵第579团后勤处协理员、炮兵营政治教导员
1994.02-1995.02步兵第五七九团副政委
1995.02-1998.02步兵第五七九团政治处主任
1998.02-2003.09六十五集团军步兵一九三师五七九团政委
2003.09―― 石家庄市安全生产监督管理局调研员

⑶ 单细胞测序的研究进展
来自斯坦福大学的Stephen Quake测定了来自一项研究的100个精子的重组率,发现了许多新的重组热点和与间接方法发现的相一致的比率。随后他更深程度地测序了8个精子足以确定突变率。他在会议上报告说发现其比率为每10亿个碱基为30个变异,略高于其他人所发现的。
纽约冷泉港实验室的研究生Timour Baslan正利用单细胞技术来研究癌细胞。他与MD安德森癌症中心的分子遗传学家Nicholas Navin展开了合作。Navin实验室曾开发一种所谓的单核测序(single-nucleus sequencing)技术绘制肿瘤图谱。他们已利用这一技术追查了癌症的进化,追踪了癌症随时间和扩散越来越普遍时不同的细胞亚群。Baslan和同事们现在在测序前会将遗传条形码添加到每个细胞上,这样使得他们能够将样本集中在一起进行测序,仍然能够识别在混合物中来自单个细胞的序列,一种节约成本的测量。
马里兰州贝塞斯达国家人类基因组研究所的遗传学家Elaine Ostrander称分析单个癌细胞的前景“令人难以置信的兴奋“,以一种“充满希望和优雅”的方式解析了正在肿瘤中发生的事件。但是另一些人则更为谨慎。“得到这些类型的数据是很难的,因为你将不得不对大量的细胞进行测序,”华盛顿大学基因组研究所共同负责人Elaine Mardis说。
哈佛大学谢晓亮院士科研团队于2012年12月21日在《Science》发表一篇关于MALBAC(Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles)的方法论文章,该方法解决了单细胞微量初始模板进行基因组扩增时过大的扩增偏倚,使基因组测序的模板需求量从µg级降至单细胞水平。该技术在研究人类精子重组方面的独特应用也在顶级科学期刊《Science》公开发表。
“MALBAC开启了一扇通往许多重要问题的大门,”加州大学圣地亚哥分校任兵(Bing Ren)说。例如,可用它来检测突变累积的速度,寻找一个细胞群中的基因拷贝数变异和染色体异常。相比其他测序方法,它还可以帮助检测更多基因组的变异。
“我认为人们将会立即开始利用它,” James Eberwine说。Eberwine在宾夕法尼亚大学Perelman医学院从事单细胞遗传学研究。他补充说研究人员或许不得不调整条件,例如引物与基因组DNA的比率,从而能够开展实验工作。
癌症单细胞测序
单细胞测序方法即single cell sequencing(SNS),能准确定量一个单细胞核中基因拷贝数目。由于癌细胞中基因组部分被删除,或者扩增,从而引起关键基因的缺失,或者表达过量,干扰正常细胞生长,因此利用这种方法就能分析基因拷贝数目,从而诊断癌症。

